Esta es una opción configurable en el config.php, la cual yo recomiendo, porque suele suceder, que cuando se esta actualizando pueden que ingresen al sistema otro usuario y al ver que el sistema solicita la actualización para avanzar, continúen con la instalación lo que nos pudiera generar fallos en la nueva actualización.
Entonces es aquí donde cobra importancia esta frase, ya que solo quien la conozca procederá con la actualización.
Estos son los pasos:
1.- Abrimos el archivo config.php con el editor de su preferencia:
# vim config.php
2.- Buscamos la variable upgradekey y le asignamos una frase,
$CFG->upgradekey = 'Por_favor';
es importante aclarar que si esta linea esta comentada no te pedira la frase, de lo contrario la pedirá siempre
3.-Ahora cuando ingreses al sistema, después de una actualización te solicitara la frase que configuraste en el config.php, para este ejemplo es Por_favor sin las comillas
Cualquier duda me puedes escribir y te ayudaré
Éxitos,